国电南自是由国家电力公司南京电力自动化设备总厂独家发起，拟以公开募集方式设立。 南自总厂本次股份制改造，将其现有的四个主专业分厂：线路保护分厂（一分厂）、调度自动化分厂（二分厂）、主设备保护分厂（九分厂）、变压器印制板分厂（七分厂）和相应职能管理部门的资产和相应的负债，以及拥有的一家全资附属企业（南京博奥电力自动化公司）、一家控股子公司（南京南自变电站自动化有限公司）。

2020年4月，入选国务院国资委“科改示范企业”名单。